-
قابل دانلود از يكشنبه, ۲۰ فروردين ۱۴۰۲
فهرست مطالب: Preface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . vContributors. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ix 1 Unveiling the Links Between Peptide Identification and Differential Analysis FDR Controls by Means of a Practical Introduction to Knockoff Filters . . . . . . . 1 2 A Pipeline for Peptide Detection Using Multiple Decoys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 3 Enhanced Proteomic Data Analysis with MetaMorpheus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 4 Validation of MS/MS Identifications and Label-Free Quantification Using Proline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 5 Integrating Identification and Quantification Uncertainty for Differential Protein Abundance Analysis with Triqler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6 Left-Censored Missing Value Imputation Approach for MS-Based Proteomics Data with GSimp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 7 Towards a More Accurate Differential Analysis of Multiple Imputed Proteomics Data with mi4limma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 8 Uncertainty-Aware Protein-Level Quantification and Differential Expression Analysis of Proteomics Data with seaMass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141 9 Statistical Analysis of Quantitative Peptidomics and Peptide-Level Proteomics Data with Prostar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163 10 msmsEDA & msmsTests: Label-Free Differential Expression by Spectral Counts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 197 11 Exploring Protein Interactome Data with IPinquiry: Statistical Analysis and Data Visualization by Spectral Counts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 12 Statistical Analysis of Post-Translational Modifications Quantified by Label-Free Proteomics Across Multiple Biological Conditions with R: Illustration from SARS-CoV-2 Infected Cells . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267 13 Fast, Free, and Flexible Peptide and Protein Quantification with FlashLFQ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303 14 Robust Prediction and Protein Selection with Adaptive PENSE . . . . . . . . . . . . . . 315 15 Multivariate Analysis with the R Package mixOmics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333 16 Integrating Multiple Quantitative Proteomic Analyses Using MetaMSD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . 361 17 Application of WGCNA and PloGO2 in the Analysis of Complex Proteomic Data. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . 375 Index . . . . . . . . . . . . . . . . . . 391 مشخصات فایل |
|
عنوان (Title): | Statistical Analysis of Proteomic Data_ Methods and Tools |
نام فایل (File name): | 904-www.GeneProtocols.ir-Statistical Analysis of Proteomic Data_ Methods and Tools-Humana Press (2022).pdf |
عنوان فارسی (Title in Persian): | آنالیز آماری داده های پروتئومیک- روشها و ابزارها |
ایجاد کننده: | Thomas Burger |
زبان (Language): | انگلیسی English |
سال انتشار: | 2022 |
شابک ISBN: | 1071619667, 9781071619667 |
نوع سند (Doc. type): | کتاب |
فرمت (File extention): | |
حجم فایل (File size): | 24.7 مگابایت |
تعداد صفحات (Book length in pages): | 398 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.