-
قابل دانلود از پنجشنبه, ۱ تیر ۱۴۰۲
|
فهرست مطالب: Preface . . . . . . . . . . . . . . vContributors. . . . . . . . . . . . . . . ix 1 DNA Methylation Data Analysis Using Msuite . . . . . . . . . 1 Xiaojian Liu, Pengxiang Yuan, and Kun Sun 2 Interactive DNA Methylation Array Analysis with ShinyE´ PICo . . . . . 7 Octavio Morante-Palacios 3 Predicting Chromatin Interactions from DNA Sequence Using DeepC. . . . . . . . . . . . . . 19 Ron Schwessinger 4 Integrating Single-Cell Methylome and Transcriptome Data with MAPLE . . . . . . . . . 43 Yasin Uzun, Hao Wu, and Kai Tan 5 Quantitative Comparison of Multiple Chromatin ImmunoprecipitationSequencing (ChIP-seq) Experiments with spikChIP. . . . . 55 Enrique Blanco, Cecilia Ballare´, Luciano Di Croce, and Sergi Aranda 6 A Guide to MethylationToActivity: A Deep Learning Framework That Reveals Promoter Activity Landscapes from DNA Methylomes in Individual Tumors . . . . . . . . . . . . 73 Karissa Dieseldorff Jones, Daniel Putnam, Justin Williams, and Xiang Chen 7 DNA Modification Patterns Filtering and Analysis Using DNAModAnnot. . . . . 87 Alexis Hardy, Sandra Duharcourt, and Matthieu Defrance 8 Methylome Imputation by Methylation Patterns. . . . . . . . 115 Ya-Ting Sabrina Chang, Ming-Ren Yen, and Pao-Yang Chen 9 Sequoia: A Framework for Visual Analysis of RNA Modifications from Direct RNA Sequencing Data . . . . . . . . . 127 Ratanond Koonchanok, Swapna Vidhur Daulatabad, Khairi Reda, and Sarath Chandra Janga 10 Predicting Pseudouridine Sites with Porpoise . . . . . 139 Xudong Guo, Fuyi Li, and Jiangning Song 11 Pseudouridine Identification and Functional Annotation with PIANO . . . 153 Jiahui Yao, Cuiyueyue Hao, Kunqi Chen, Jia Meng, and Bowen Song 12 Analyzing mRNA Epigenetic Sequencing Data with TRESS . . . . . . . 163 Zhenxing Guo, Andrew M. Shafik, Peng Jin, Zhijin Wu, and Hao Wu 13 Nanopore Direct RNA Sequencing Data Processing and Analysis Using MasterOfPores . . . . . . . . . . . 185 Luca Cozzuto, Anna Delgado-Tejedor, Toni Hermoso Pulido, Eva Maria Novoa, and Julia Ponomarenko vii viii Contents 14 Data Analysis Pipeline for Detection and Quantification of Pseudouridine (ψ) in RNA by HydraPsiSeq . . . . . . . 207 Florian Pichot, Virginie Marchand, Mark Helm, and Yuri Motorin 15 Analysis of RNA Sequences and Modifications Using NASE . . . . . . . 225 Samuel Wein 16 Mapping of RNA Modifications by Direct Nanopore Sequencing and JACUSA2. . . . . . . . . . . . . 241 Amina Lemsara, Christoph Dieterich, and Isabel S. Naarmann-de Vries Index . . . . . . . . . . . . . . . 261 مشخصات فایل |
|
| عنوان (Title): | Computational Epigenomics and Epitranscriptomics |
| نام فایل (File name): | 1005-www.GeneProtocols.ir-Computational Epigenomics and Epitranscriptomics-Humana Press (2023).pdf |
| عنوان فارسی (Title in Persian): |
اپی ژنومیکس و اپی ترنسکریپتومیکس محاسباتی
|
| ایجاد کننده: | Pedro H. Oliveira |
| زبان (Language): | انگلیسی English |
| سال انتشار: | 2023 |
| شابک ISBN: | 9781071629611 |
| نوع سند (Doc. type): | کتاب |
| فرمت (File extention): | |
| حجم فایل (File size): | 13.9 مگابایت |
| تعداد صفحات (Book length in pages): | 267 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.
