فهرست مطالب کتاب بیوانفورماتیک ریزآرایه:

Preface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . v

Contributors. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ix

1 Introduction to Bioinformatics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

2 Protocol for DNA Microarrays on Glass Slides. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

3 Data Warehousing with TargetMine for Omics Data Analysis. . . . . . . . . . . . . . . . . 35

4 A Review of Microarray Datasets: Where to Find Them and Specific Characteristics . .. . . . 65

5 Statistical Analysis of Microarray Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87

6 Feature Selection Applied to Microarray Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123

7 Cluster Analysis of Microarray Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153

8 Classification of Microarray Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185

9 Microarray Data Normalization and Robust Detection of Rhythmic Features. . . . .  . 207

10 HPC Tools to Deal with Microarray Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 227

11 ROC Curves for the Statistical Analysis of Microarray Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245

12 Missing-Values Imputation Algorithms for Microarray Gene Expression Data . . . . 255

13 Computer Tools to Analyze Microarray Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267

14 Challenges and Future Trends for Microarray Analysis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283
Index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 295

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