-
قابل دانلود از پنجشنبه, ۲۸ ارديبهشت ۱۴۰۲
|
فهرست مطالب: Preface........... . . . vContributors........... . . . . ix 1 Guidance on Processing the 10x Genomics Single Cell Gene Expression Assay........... 1 Katharina Danielski 2 BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System Workflow: From Sample to Multimodal Single-Cell Sequencing Data...... . 29 Jannes Ulbrich, Vadir Lopez-Salmeron, and Ian Gerrard 3 Profiling Transcriptional Heterogeneity with Seq-Well S3: A Low-Cost, Portable, High-Fidelity Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq........ . . . . 57 Riley S. Drake, Martin Arreola Villanueva, Mike Vilme, Daniela D. Russo, Andrew Navia, J. Christopher Love, and Alex K. Shalek 4 A MATQ-seq-Based Protocol for Single-Cell RNA-seq in Bacteria.. 105 Christina Homberger, Antoine-Emmanuel Saliba, and Jo ¨rg Vogel 5 Full-Length Single-Cell RNA-Sequencing with FLASH-seq... . . . . . 123 Vincent Hahaut and Simone Picelli 6 Plant Single-Cell/Nucleus RNA-seq Workflow.... . . . . . 165 Sandra Thibivilliers, Andrew Farmer, Susan Schroeder, and Marc Libault 7 Ensuring Quality Cell Input for Single Cell Sequencing Experiments by Viability and Singlet Enrichment Using Cell Sorting... . . . 183 Malte Paulsen 8 Tissue RNA Integrity in Visium Spatial Protocol (Fresh Frozen Samples). 191 Federica Antico, Marta Gai, and Maddalena Arigoni 9 Single-Cell RNAseq Data QC and Preprocessing.... . . . 205 Martina Olivero and Raffaele A. Calogero 10 Single-Cell RNAseq Complexity Reduction..... . . 217 Francesca Cordero and Raffaele A. Calogero 11 Functional-Feature-Based Data Reduction Using Sparsely Connected Autoencoders......... . . . . 231 Luca Alessandri and Raffaele A. Calogero 12 Single-Cell RNAseq Clustering....... . 241 Marco Beccuti and Raffaele A. Calogero 13 Identifying Gene Markers Associated with Cell Subpopulations... . . 251 Maria Luisa Ratto and Luca Alessandri vii viii Contents 14 A Guide to Trajectory Inference and RNA Velocity.... . 269 Philipp Weiler, Koen Van den Berge, Kelly Street, and Simone Tiberi 15 Integration of scATAC-Seq with scRNA-Seq Data.... . . 293 Ivan Berest and Andrea Tangherloni 16 Using “Galaxy-rCASC”: A Public Galaxy Instance for Single-Cell RNA-Seq Data Analysis......... . 311 Pietro Mandreoli, Luca Alessandri, Raffaele A. Calogero, Marco Antonio Tangaro, and Federico Zambelli 17 Bringing Cell Subpopulation Discovery on a Cloud-HPC Using rCASC and StreamFlow......... . . 337 Sandro G. Contaldo, Luca Alessandri, Iacopo Colonnelli, Marco Beccuti, and Marco Aldinucci 18 Profiling RNA Editing in Single Cells...... . 347 Adriano Fonzino, Graziano Pesole, and Ernesto Picardi 19 Practical Considerations for Complex Tissue Dissociation for Single-Cell Transcriptomics....... . 371 Stephanie T. Pohl, Maria Llamazares Prada, Elisa Espinet, and Renata Jurkowska Index........... . . . . 389 مشخصات فایل |
|
| عنوان (Title): | Single Cell Transcriptomics_ Methods and Protocols |
| نام فایل (File name): | 982-www.GeneProtocols.ir-Single Cell Transcriptomics_ Methods and Protocols-Humana Press (2023).pdf |
| عنوان فارسی (Title in Persian): |
ترنسکریپتومیکس تک سلول _ روش ها و پروتکل ها
|
| ایجاد کننده: | Raffaele A. Calogero, Vladimir Benes |
| زبان (Language): | انگلیسی English |
| سال انتشار: | 2023 |
| شابک ISBN: | 9781071627556 |
| نوع سند (Doc. type): | کتاب |
| فرمت (File extention): | |
| حجم فایل (File size): | 10.4 مگابایت |
| تعداد صفحات (Book length in pages): | 394 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید
برچسب ها:
2023,
انگلیسی,
اومیکس,
ترنسکریپتوم,
سلول شناسی,
سیتوژنتیک,
پروتکل سلولی مولکولی,
پروتکل ژنتیک,
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.
