دانلود کتاب، اطلس، پروتکل، هندبوک، مقاله فارسی/ پزشکی، بیولوژی، کشاورزی و...

  • geneprotocols@gmail.com

دانلود کتابهای پزشکی، ژنتیک، بیولوژی | قدرت گرفته از بیان

توالی یابی نانوپور - روشها و پروتکل ها Nanopore Sequencing_ Methods and Protocols

توالی یابی نانوپور - روشها و پروتکل ها Nanopore Sequencing_ Methods and Protocols

همه دسته بندی های سایت

 فهرست مطالب:

Preface .......... . . . . . v
Contributors.......... . ix
PART I NANOPORE SEQUENCING FOR GENOMICS AND BEYOND
1 The Current State of Nanopore Sequencing..... . . . 3
2 Hybrid Genome Assembly of Short and Long Reads in Galaxy ... 15
3 Microbial Genome Sequencing and Assembly Using Nanopore Sequencers . . . . 31
4 De Novo Genome Assembly of Japanese Black Cattle as Model of an Economically Relevant Animal...... . . . 41
5 How to Sequence and Assemble Plant Genomes ....57
6 Detection of DNA Modification Using Nanopore Sequencers ... . 79
7 Ultralow-Input Genome Library Preparation for Nanopore Sequencing with Droplet MDA........ . . . . 91
8 The Method of Eliminating the Wolbachia Endosymbiont Genomes from Insect Samples Prior to a Long-Read Sequencing .... 101
9 A Nanopore Sequencing Course for Graduate School Curriculum .. . . . . 113
PART II ANALYSIS OF REPETITIVE REGIONS AND STRUCTURAL VARIANTS
10 A Guide to Sequencing for Long Repetitive Regions .... . . 131
11 Analysis of Tandem Repeat Expansions Using Long DNA Reads .. . . . . . 147
12 Finding Rearrangements in Nanopore DNA Reads with LAST and dnarrange ......... . 161
13 Long-Read Whole-Genome Sequencing Using a Nanopore Sequencer and Detection of Structural Variants in Cancer Genomes ... . . . . . 177
PART III RAPID ON-SITE MICROBIAL DETECTION AND EPIDEMIOLOGY
14 Full-Length 16S rRNA Gene Analysis Using Long-Read Nanopore Sequencing for Rapid Identification of Bacteria from Clinical Specimens ... . . 193
15 Nanopore Sequencing Data Analysis of 16S rRNA Genes Using the GenomeSync-GSTK System ...... 215
16 Genomic Epidemiological Analysis of Antimicrobial-Resistant Bacteria with Nanopore Sequencing ....... . . . 227
17 Rapid and Comprehensive Identification of Nontuberculous Mycobacteria . . . . 247
PART IV NANOPORE SEQUENCING FOR TRANSCRIPTOMICS AND BEYOND
18 Long-Read Single-Cell Sequencing Using scCOLOR-seq... . . . . . 259
19 Unfolding the Bacterial Transcriptome Landscape Using Oxford Nanopore Technology Direct RNA Sequencing ...... . . 269
20 Nanopore Direct RNA Sequencing of Monosomeand Polysome-Bound RNA ....... . . . 281
21 RNA Modification Detection Using Nanopore Direct RNA Sequencing and nanoDoc2 ......... 299
Index ..........321  

     

فهرست به فارسی (ترجمه ماشینی):

پیشگفتار ........... . . . . v
مشارکت کنندگان........... ix
بخش اول توالی یابی نانوحفره برای ژنومیک و فراتر از آن
1 وضعیت فعلی توالی یابی نانوحفره ..... . . . 3
2 مجموعه ژنوم هیبریدی قرائت های کوتاه و بلند در کهکشان ... 15
3 توالی یابی و مونتاژ ژنوم میکروبی با استفاده از توالی یابی نانوحفره. . . . 31
4 مونتاژ ژنوم De Novo گاو سیاه ژاپنی به عنوان مدل یک حیوان اقتصادی مرتبط...... . . . 41
5 نحوه توالی و جمع آوری ژنوم گیاهان ....57
6 تشخیص اصلاح DNA با استفاده از توالی یابی نانوحفره ... . 79
7 آماده سازی کتابخانه ژنوم با ورودی بسیار کم برای توالی یابی نانوحفره با قطره MDA......... . . . . 91
8 روش حذف ژنوم اندوسیمبیونت Wolbachia از نمونه های حشرات قبل از توالی خوانی طولانی .... 101
9 یک دوره توالی نانوحفره برای برنامه درسی مدارس تحصیلات تکمیلی .. . . . . 113
بخش دوم تجزیه و تحلیل مناطق تکراری و متغیرهای ساختاری
10 راهنمای توالی برای مناطق تکراری طولانی .... . . 131
11 تجزیه و تحلیل انبساط های تکراری پشت سر هم با استفاده از خواندن طولانی DNA .. . . . . . 147
12 یافتن بازآرایی در خواندن DNA نانوحفره با LAST و dnarrange ......... . 161
13 توالی یابی کل ژنوم با خواندن طولانی با استفاده از توالی یابی نانوحفره و تشخیص انواع ساختاری در ژنوم های سرطان ... . . . . . 177
بخش سوم: تشخیص سریع میکروبی و اپیدمیولوژی در محل
14 تجزیه و تحلیل ژن 16S rRNA تمام طول با استفاده از توالی یابی نانوحفره طولانی خوانده شده برای شناسایی سریع باکتری ها از نمونه های بالینی ... . . 193
15 تجزیه و تحلیل داده های توالی یابی نانوحفره ژن های 16S rRNA با استفاده از سیستم GenomeSync-GSTK ...... 215
16 تجزیه و تحلیل اپیدمیولوژیک ژنومی باکتری های مقاوم به ضد میکروبی با توالی یابی نانوحفره ....... . . . 227
17 شناسایی سریع و جامع مایکوباکتریوم های غیر سلی. . . . 247
بخش چهارم توالی یابی نانوپور برای رونویسی و فراتر از آن
18 توالی خوانی طولانی تک سلولی با استفاده از scCOLOR-seq... . . . . . 259
19 آشکارسازی منظره رونویسی باکتری با استفاده از فناوری نانوحفره آکسفورد توالی یابی مستقیم RNA ...... . . 269
20 توالی RNA مستقیم نانوحفره RNA مونوزومی و پلیزومی محدود ........ . . . 281
21 تشخیص اصلاح RNA با استفاده از توالی یابی مستقیم RNA نانوپوره و nanoDoc2 ......... 299
شاخص ..........321

مشخصات فایل

عنوان (Title): Nanopore Sequencing_ Methods and Protocols
نام فایل (File name): 1181-www.GeneProtocols.ir-Nanopore Sequencing_ Methods and Protocols-Humana Press (2023).pdf
عنوان فارسی (Title in Persian):

توالی یابی نانوپور - روشها و پروتکل ها

ایجاد کننده: Kazuharu Arakawa
زبان (Language): انگلیسی English
سال انتشار: 2023
شابک ISBN:

ISBN 978-1-0716-2995-6

ISBN 978-1-0716-2996-3

نوع سند (Doc. type): کتاب
فرمت (File extention): PDF
حجم فایل (File size): 12 مگابایت
تعداد صفحات (Book length in pages): 318

پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود

درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید

 

تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.

لطفاً با ارسال نظرات و پیشنهادات خود، ما را یاری کنید
    تمامی نظرات و پیشنهادات شما توسط مدیران و مسئول سایت بررسی و رسیدگی می شوند. بسیاری از اصلاحات انجام شده در سایت طبق نظرات و پیشنهادات شما مخاطبان عزیز صورت گرفته است.
ارسال نظر آزاد است، اما اگر قبلا در بیان ثبت نام کرده اید می توانید ابتدا وارد شوید.
شما میتوانید از این تگهای html استفاده کنید:
<b> یا <strong>، <em> یا <i>، <u>، <strike> یا <s>، <sup>، <sub>، <blockquote>، <code>، <pre>، <hr>، <br>، <p>، <a href="" title="">، <span style="">، <div align="">