فهرست مطالب:

1 Introduction to Bioinformatics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

2 Introduction to Biological Databases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19

3 Sequence Databases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29

4 Biological 3D Structural Databases. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47

5 Other Biological Databases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75

6 Introduction to Nucleic Acid Sequencing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97

7 Tools and Methods in the Analysis of Simple Sequences. . . . . . . . . . . . 127

8 Tools and Methods in Analysis of Complex Sequences . . . . . . . . . . . . . 155

9 Structural Bioinformatics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169

10 Protein Structure Annotations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201

11 Introduction to Functional Bioinformatics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 235

12 Biological Networks: Tools, Methods, and Analysis. . . . . . . . . . . . . . . . 255

13 Metabolomics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287

14 Drug Discovery: Concepts and Approaches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319

15 Molecular Docking . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335

16 In Silico PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355

17 Modeling and Optimization of Molecular Biosystems

to Generate Predictive Models. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 373

Index. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 389