-
قابل دانلود از شنبه, ۱۳ خرداد ۱۴۰۲
|
فهرست مطالب: Preface........... . . . vContributors........... . . . . xi 1 An Overview of Best Practices for Transposable Element Identification, Classification, and Annotation in Eukaryotic Genomes... . . . . 1 Fernando Rodriguez and Irina R. Arkhipova 2 Assembly-Free Detection and Quantification of Transposable Elements with dnaPipeTE......... . . 25 Cle´ment Goubert 3 Detecting Horizontal Transfer of Transposons.... . . . . . 45 James D. Galbraith, Atma M. Ivancevic, Zhipeng Qu, and David L. Adelson 4 Genotyping of Transposable Element Insertions Segregating in Human Populations Using Short-Read Realignments...... 63 Xun Chen, Guillaume Bourque, and Cle´ment Goubert 5 A Pangenome Approach to Detect and Genotype TE Insertion Polymorphisms......... . . . 85 Cristian Groza, Guillaume Bourque, and Cle´ment Goubert 6 Experimental Validation of Transposable Element Insertions Using the Polymerase Chain Reaction (PCR)...... 95 Miriam Merenciano, Marta Coronado-Zamora, and Josefa Gonza´lez 7 Quantification of LINE-1 RNA Expression from Bulk RNA-seq Using L1EM......... . . . . . 115 Wilson McKerrow 8 Genome-Wide Young L1 Methylation Profiling by bs-ATLAS-seq.. 127 Claude Philippe and Gael Cristofari 9 Nanopore Sequencing to Identify Transposable Element Insertions and Their Epigenetic Modifications...... . . . 151 Nathan Smits and Geoffrey J. Faulkner 10 Targeted Nanopore Resequencing and Methylation Analysis of LINE-1 Retrotransposons......... . 173 Arpita Sarkar, Sophie Lanciano, and Gael Cristofari 11 Inferring Protein-DNA Binding Profiles at Interspersed Repeats Using HiChIP and PAtChER....... . . 199 Darren Taylor and Miguel R. Branco 12 Affinity-Based Interactome Analysis of Endogenous LINE-1 Macromolecules......... . . 215 Luciano H. Di Stefano, Leila J. Saba, Mehrnoosh Oghbaie, Hua Jiang, Wilson McKerrow, Maria Benitez-Guijarro, Martin S. Taylor, and John LaCava ix x Contents 13 LINE-1 Retrotransposition Assays in Embryonic Stem Cells.. . . . . . 257 Marta Garcia-Can˜adas, Francisco J. Sanchez-Luque, Laura Sanchez, Johana Rojas, and Jose L. Garcia Perez 14 Experimental Approaches to Study Somatic Transposition in Drosophila Using Whole-Genome DNA Sequencing..... . . . . 311 Marius van den Beek, Natalia Rubanova, and Katarzyna Siudeja 15 Precise and Scarless Insertion of Transposable Elements by Cas9-Mediated Genome Engineering......... . . . 329 Vivien Marie Weber, Aure´lien J. Doucet, and Gael Cristofari 16 Epigenetic Manipulation of Transposable and Repetitive Elements.. . . . . . 355 Joanna W. Jachowicz 17 Genetic Knockout of TE Insertions by CRISPR-Cas9... . . . . . 369 David M. Simpson and Edward B. Chuong Index........... . . . . 381 مشخصات فایل |
|
| عنوان (Title): | Transposable Elements_ Methods and Protocols |
| نام فایل (File name): | 996-www.GeneProtocols.ir-Transposable Elements_ Methods and Protocols-Humana Press (2023).pdf |
| عنوان فارسی (Title in Persian): |
عناصر جابجاشونده - روشها و پروتکل ها
|
| ایجاد کننده: | Miguel R. Branco, Alexandre de Mendoza Soler |
| زبان (Language): | انگلیسی English |
| سال انتشار: | 2023 |
| شابک ISBN: | 9781071628829 |
| نوع سند (Doc. type): | کتاب |
| فرمت (File extention): | |
| حجم فایل (File size): | 13.6 مگابایت |
| تعداد صفحات (Book length in pages): | 387 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.
