-
قابل دانلود از پنجشنبه, ۲۴ فروردين ۱۴۰۲
|
فهرست مطالب: Preface . . . . . . . . . . . . . . vContributors. . . . . . . . . . . . . . . ix PART I PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 1 Orthology Prediction and Phylogenetic Analysis Methods in Plants. . . . . . . . . . 3 Abdoallah Sharaf and Sawsan Elateek 2 Species Tree Inference with SNP Data . . . . . . . 23 Michael Matschiner 3 High-Throughput Evolutionary Comparative Analysis of Long Intergenic Noncoding RNAs in Multiple Organisms . . . . 45 Anna C. Nelson Dittrich and Andrew D. L. Nelson 4 NGS-Indel Coder v2.0: A Streamlined Pipeline to Code Indel Characters in Phylogenomic Data . . . . . . . . . . . 61 Julien Boutte, Mark Fishbein, and Shannon C. K. Straub 5 An SGSGeneloss-Based Method for Constructing a Gene Presence–Absence Table Using Mosdepth . . . . . . . . 73 Cassandria G. Tay Fernandez, Jacob I. Marsh, Benjamin J. Nestor, Mitchell Gill, Agnieszka A. Golicz, Philipp E. Bayer, and David Edwards 6 POInT: A Tool for Modeling Ancient Polyploidies Using Multiple Polyploid Genomes . . . . . . . . . . . . . 81 Yue Hao and Gavin C. Conant PART II OMICS ANALYSIS 7 Searching for Homologous Genes Using Daisychain . . . . 95 Philipp E. Bayer and David Edwards 8 Detecting MicroRNAs in Plant Genomes with miRkwood . . . . 103 Sylvain Legrand, Isabelle Guigon, and He´le`ne Touzet 9 Pangenome Analysis of Plant Transcripts and Coding Sequences. . . . 121 Bruno Contreras-Moreira, A´ lvaro Rodrı´guez del Rı´o, Carlos P. Cantalapiedra, Rube´n Sancho, and Pablo Vinuesa 10 Metagenomics Bioinformatic Pipeline . . . . . . . 153 Diego Garfias-Gallegos, Claudia Zirion-Martı´nez, Edder D. Bustos-Dı´az, Tania Vanessa Arellano-Ferna´ndez, Jose´ Abel Lovaco-Flores, Aaron Espinosa-Jaime, J. Abraham Avelar-Rivas, and Nelly Se´lem-Mojica 11 Rhizosphere and Endosphere Bacterial Communities Survey by Metagenomics Approach. . . . . . . . . . . 181 Victoria Mesa vii12 Applying Synteny Networks (SynNet) to Study Genomic Arrangements of Protein-Coding Genes in Plants. . . . . . . 199 Samuel David Gamboa-Tuz, Alejandro Pereira-Santana, Tao Zhao, and M. Eric Schranz 13 Plant In Situ Hi-C Experimental Protocol and Bioinformatic Analysis . . . . . . . . . . . . 217 Francisco J. Pe´rez-de los Santos, Jesu´ s Emiliano Sotelo-Fonseca, Ame´rica Ramı´rez-Colmenero, Hans-Wilhelm Nu¨tzmann, Selene L. Fernandez-Valverde, and Katarzyna Oktaba 14 Isolation of Boechera stricta Developing Embryos for Hi-C . . . 249 Mariana Tiscaren˜o-Andrade, Katarzyna Oktaba, and Jean-Philippe Vielle-Calzada PART III EXPERIMENTAL PROCEDURES FOR TRAIT CHARACTERIZATION 15 Discovering the Secrets of Ancient Plants: Recovery of DNA from Museum and Archaeological Plant Specimens . . . . . 261 Oscar Estrada, Stephen M. Richards, and James Breen 16 Use of Allele-Specific Amplification for Rapid Identification of Aromatic and Non-aromatic Rice Germplasms . . . . . . . 269 Debarati Chakraborty 17 Efficient Protein Extraction Protocols for NanoLC-MS/MS Proteomics Analysis of Plant Tissues with High Proteolytic Activity: A Case Study with Pineapple Pulp . . . . . . . . . . . . . 281 Esau´ Bojorquez-Vela´zquez, Jose´ M. Elizalde-Contreras, Jesu´ s Alejandro Zamora-Brisen˜o, and Eliel Ruiz-May Index . . . . . . . . . . . . . . . 291 مشخصات فایل |
|
| عنوان (Title): | Plant Comparative Genomics |
| نام فایل (File name): | 924-www.GeneProtocols.ir-Plant Comparative Genomics-Humana (2022).pdf |
| عنوان فارسی (Title in Persian): | ژنومیک مقایسه ای گیاهی |
| ایجاد کننده: | Alejandro Pereira-Santana, Samuel David Gamboa-Tuz, Luis Carlos Rodríguez-Zapata |
| زبان (Language): | انگلیسی English |
| سال انتشار: | 2022 |
| شابک ISBN: | 1071624288, 9781071624289 |
| نوع سند (Doc. type): | کتاب |
| فرمت (File extention): | |
| حجم فایل (File size): | 8.97 مگابایت |
| تعداد صفحات (Book length in pages): | 293 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید
برچسب ها:
2022,
انگلیسی,
بیوانفورماتیک,
پروتکل آزمایشگاهی,
پروتکل ژنتیک,
پروتکل گیاهی,
ژنوم,
ژنومیکس,
گیاه شناسی,
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.
