ژنـ پروتکل، مرجع جدیدترین یافته های علمی، روشها، پروتکل ها، کتاب ها و اطلس ها

  • geneprotocols@gmail.com

مرجع دانلود کتابها و منابع علوم زیستی | قدرت گرفته از بیان

کاربردهای عملی زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics2019

  • ۱۵
کاربردهای عملی زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics2019

فهرست مطالب:

Contents

A Hybrid of Simple Constrained Artificial Bee Colony Algorithm

and Flux Balance Analysis for Enhancing Lactate and Succinate

in Escherichia Coli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

Parameter Estimation of Essential Amino Acids in Arabidopsis

thaliana Using Hybrid of Bees Algorithm and Harmony Search . . . . . . 9

In Silico Modeling and Simulation Approach for Apoptosis

Caspase Pathways . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

Molecular Dynamic Simulations Suggest that P152R Mutation

Within MeCP2 Can Lead to Higher DNA Binding Affinity

and Loss of Selective Binding to Methylated DNA . . . . . . . . . . . . . . . . . 27

Impact of Genealogical Features in Transthyretin Familial

Amyloid Polyneuropathy Age of Onset Prediction . . . . . . . . . . . . . . . . . 35

Feature Selection and Polydispersity Characterization

for QSPR Modelling: Predicting a Tensile Property. . . . . . . . . . . . . . . . 43

Methods of Creating Knowledge Graph by Linking Biological

Databases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52

QSAR Modelling for Drug Discovery: Predicting the Activity

of LRRK2 Inhibitors for Parkinson’s Disease Using

Cheminformatics Approaches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63

Improving the Use of Deep Convolutional Neural Networks

for the Prediction of Molecular Properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71

An Analysis of Symmetric Words in Human DNA:

Adjacent vs Non-adjacent Word Distances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80

A Bioinformatics Protocol for Quickly Creating Large-Scale

Phylogenetic Trees . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88

Deep Learning Analysis of Binding Behavior of Virus Displayed

Peptides to AuNPs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97

Compression of Amino Acid Sequences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105

NET-ASAR: A Tool for DNA Sequence Search Based

on Data Compression . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114

Can an Integrative SNP Approach Substitute Standard

Identification in Comprehensive Case/Control Analyses? . . . . . . . . . . . . 123

Simple Pattern-only Heuristics Lead to Fast Subgraph Matching

Strategies on Very Large Networks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131

ContentsIn Silico Predictions for Fucoxanthin Production by the Diatom

Phaeodactylum Tricornutum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139

EvoPPI: A Web Application to Compare Protein-Protein Interactions

(PPIs) from Different Databases and Species . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149

A Review on Metabolomics Data Analysis for Cancer Applications . . . . 157

A Framework for the Automatic Combination and Evaluation

of Gene Selection Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166

Parallel Cellular Automaton Tumor Growth Model . . . . . . . . . . . . . . . . 175

MOSCA: An Automated Pipeline for Integrated Metagenomics

and Metatranscriptomics Data Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183

Metabolite Integration Pipeline for the Improvement of Human

Metabolic Models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192

A Genetic Programming Approach Applied to Feature Selection

from Medical Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200

A DNA Sequence Corpus for Compression Benchmark . . . . . . . . . . . . . 208

17a-Ethinylestradiol Analysis of Endo- and Exometabolome of Ulva

lactuca (Chlorophyta) by 1H-NMR Spectroscopy

and Bioinformatics Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216

Author Index. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 225

مشخصات فایل

عنوان (Title): Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics
نام فایل (File name): 622-www.GeneProtocols.ir-Practical Applications of Computational Biology and .pdf
عنوان فارسی (Title in Persian): کاربردهای عملی زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک
ایجاد کننده: Florentino Fdez-Riverola, Mohd Saberi Mohamad, Miguel Rocha, Juan F. De Paz, Pascual González
زبان (Language): انگلیسی English
سال انتشار: 2019
شابک ISBN: 978-3-319-98701-9;978-3-319-98702-6
نوع سند (Doc. type): کتاب
فرمت (File extention): PDF
حجم فایل (File size): 20/6
تعداد صفحات (Book length in pages): 239

پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود

نظرات: (۰) نظر خود را ارسال کنید
ارسال نظر آزاد است، اما اگر قبلا در بیان ثبت نام کرده اید می توانید ابتدا وارد شوید.
شما میتوانید از این تگهای html استفاده کنید:
<b> یا <strong>، <em> یا <i>، <u>، <strike> یا <s>، <sup>، <sub>، <blockquote>، <code>، <pre>، <hr>، <br>، <p>، <a href="" title="">، <span style="">، <div align="">
تجدید کد امنیتی